Choroby svojím poškodením listov obmedzujú účinnosť fotosyntézy a s tým spojený výnos koreňa a cukornatosť. Niektorým chorobám treba venovať zvýšenú pozornosť, ale sú aj choroby, ktoré hospodárske škody v našich podmienkach zatiaľ nespôsobujú, avšak je dobré ich poznať. Ochrana cukrovej repy je v dnešnej dobre riešená fungicídnymi prípravkami, či už sú to systémové prípravky, alebo kontaktné. Každý poľnohospodár si môže  vybrať z ponuky chemických firiem tie svoje „obľúbené“. Účinnosť  látok je rôzna, tak isto ako spektrum pôsobenia. Cukrovary odporúčajú vo všeobecnosti aplikovať 2x fungicíd, z dôvodu zachovania kvalitného listového aparátu a tým zabezpečenia plynulého prechodu do tvorby koreňa a neposlednom rade aj sacharózy.